Kościół i klasztor franciszkanów w pobliżu Bramy Lwowskiej zaczyna się 18 lutego 1636 roku kiedy to ordynat Tomasz Zamoyski akceptuje przedłożony mu projekt i wyznacza granice pod ich budowę. 13 czerwca 1636 roku uroczyście obchodzi się wmurowanie kamienia węgielnego pod budowę kościoła pod wezwaniem Zwiastowania Najświętszej Marii Panny i świętych Franciszka i Antoniego, Katarzyny i Barbary zostaje ufundowana przez Tomasza Zamoyskiego i jego małżonkę Katarzynę z Ostrogskich i nic dziwnego, gdyż wezwaniom tylu świętych mógł sprostać tylko sam właściciel miasta. Bazylika została ukończona w 1662 roku. Robotami przy kościele kierował Jan Link. To on nadał kościołowi tak specyficzną i odmienną od tradycji renesansowej formę. Jego wschodni i zachodni szczyt jest dwukrotnie wyższy od ścian. Wielka skala szczytów, dwukondygnacyjne elewacje i niezwykłe bogactwo kamieniarskich detali sytuuje świątynię w kręgu architektury barokowej.